戰(zhàn)“疫”快訊

　　科技日?qǐng)?bào)訊 (記者劉志偉 通訊員吳江龍 陳麗霞)近日，記者從武漢大學(xué)獲悉，該校聯(lián)合團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性開發(fā)出納米孔靶向測(cè)序(NTS)檢測(cè)方法，能大幅提升病毒陽(yáng)性檢出率，實(shí)現(xiàn)一天同時(shí)檢測(cè)新型冠狀病毒和其他10大類、40種常見呼吸道病毒并監(jiān)測(cè)病毒突變。3月7日，該團(tuán)隊(duì)在預(yù)印本平臺(tái)medRxiv正式發(fā)表題為《納米孔靶向測(cè)序精準(zhǔn)全面檢測(cè)新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究論文。

　　據(jù)了解，以往新冠病毒診斷主要采用的是實(shí)時(shí)熒光定量核酸擴(kuò)增檢測(cè)系統(tǒng)(qPCR)，但是該方法顯示出低敏感性。此外，qPCR核酸檢測(cè)無(wú)法同時(shí)檢測(cè)其他秋冬季高發(fā)、引發(fā)癥狀與新冠肺炎相似的其他呼吸道病毒，給疫情防控和患者分流管理帶來(lái)極大挑戰(zhàn)。

　　武漢大學(xué)藥學(xué)院劉天罡教授、武漢大學(xué)人民醫(yī)院李艷教授、余鋰鐳教授、武漢臻熙醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司總負(fù)責(zé)人付愛思博士等迅速組建聯(lián)合團(tuán)隊(duì)，創(chuàng)新性地開發(fā)了納米孔靶向測(cè)序檢測(cè)方法。

　　該團(tuán)隊(duì)研發(fā)的NTS技術(shù)特點(diǎn)在于：它不局限于中國(guó)或美國(guó)疾病控制中心目前在qPCR方法中推薦的位點(diǎn)，而是將檢測(cè)范圍擴(kuò)大到9個(gè)基因、12個(gè)位點(diǎn)近1萬(wàn)個(gè)堿基(10kb)區(qū)域，全面覆蓋病毒基因組上主要基因區(qū)域，100%覆蓋病毒基因組上毒力相關(guān)的重要基因，檢測(cè)病毒基因組范圍較目前廣泛使用的qPCR提升100倍，從而顯著提高檢測(cè)敏感性和準(zhǔn)確性。

　　劉天罡介紹，qPCR就像是用一把狙擊槍去擊打樣本中的病毒核酸，有一定概率打不中，而NTS不是用狙擊槍，而是撒網(wǎng)，并且同時(shí)撒十幾張網(wǎng)，這樣捕獲病毒核酸的概率就大大增加，不僅如此，它還能在捕獲病毒核酸的同時(shí)讀出其序列。這樣，一次檢測(cè)不僅可以確診是否感染新冠病毒，而且其他常見的呼吸道病毒，包括呼吸道合胞病毒、冠狀病毒、腺病毒、副流感病毒、甲乙丙型流感病毒等，也能同時(shí)檢測(cè)出來(lái)，為醫(yī)生分診提供確切依據(jù)。更重要的是，這種方法還能檢測(cè)在病毒傳播期間與毒力相關(guān)的基因是否發(fā)生了突變，從而迅速為后續(xù)的流行病學(xué)分析提供信息。

　　在研究中，團(tuán)隊(duì)平行測(cè)試了NTS和qPCR兩種方法。結(jié)果表明：45個(gè)臨床高度疑似新型冠狀病毒感染患者的樣品，NTS共鑒定出34個(gè)陽(yáng)性樣品，比qPCR多檢出15個(gè);16個(gè)臨床已確診新型冠狀病毒感染患者中，NTS全部檢測(cè)呈陽(yáng)性。臨床確診樣本顯示，NTS比qPCR的陽(yáng)性檢出率提升43.8%。

　　此外，對(duì)于高濃度病毒樣本，NTS僅需測(cè)序10分鐘即可檢測(cè)出結(jié)果。即使極低濃度病毒樣本，也僅需測(cè)序4小時(shí)就可完成檢測(cè)。從收到樣本到出具結(jié)果，全程控制在6—10小時(shí)。而且該技術(shù)所需的納米孔測(cè)序平臺(tái)對(duì)實(shí)驗(yàn)室要求不高，其中最小測(cè)序儀MinION是便攜式的，因此NTS也更適合不同級(jí)別的醫(yī)院使用。

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